卵巢上的包块有良性跟恶性，要确诊是良性的包块还是恶性，都需要经病理确诊。但大部分卵巢上的囊肿根据临床的症状，妇科的检查、超声及抽血等检查，一般都可以评估出是良性肿瘤还是恶性肿瘤，一般判断是良性还是恶性可以通过下面四点来评价：
1.良性肿瘤一般生长都较缓慢，病程时间较长，而恶性肿瘤生长速度很快，可以在短期迅速增大。
2.妇科检查良性的囊肿多见于一侧，活动度很好，触摸包块表面是很光滑的；恶性肿瘤常为两侧卵巢都有包块，它的活动度很差、固定的、包块多呈囊实性或实性。
3.良性囊肿一般患者情况较好，无饮食，体重的明显改变；而恶性肿瘤容易出现饮食及体重的异常。
4.超声下检查良性囊肿内为液性暗区，可见间隔光带，边界清楚，抽血肿瘤标记物检查正常；而恶性肿瘤超声下面可见包块内回声是杂乱的，肿块边界不清楚，可见盆腔有积液等，抽血的肿瘤标记物一般会升高。
虽临床大部分的卵巢上囊肿基本可以判断是良恶性或者是恶性的，但不是金标准。同时因卵巢在盆腔深部早期容易漏诊，所以对卵巢囊肿持续存在，超过5厘米，实性肿瘤不管大小，还是都建议手术探查，避免耽误病情。