如果新生儿黄疸并发核黄疸有可能会留有后遗症，最常见的就是听力受损伤。
如果新生儿的黄疸程度比较重，血液中的未结合胆红素浓度过高，通过血脑屏障进入脑组织，有可能会影响到中枢神经系统，引起永久性的损害。
引起核黄疸的最常见原因就是新生儿溶血，所以新生儿出生以后每天都应该检测孩子黄疸的变化。如果黄疸数值增长得比较快，每天增高值超过了五毫克每分升，或者黄疸的程度重，最高值超过了12.9毫克每分升，都属于异常情况，都需要积极处理。