小儿疱疹性角膜、结膜炎，一般主要需要使用抗病毒的眼药水进行治疗，比如更昔洛韦、阿昔洛韦类药物，主要是因为疱疹性角结膜炎是因为疱疹病毒感染导致。
此外，还需要注意患侧眼的皮肤是否也并发有疱疹，如果皮肤上也有疱疹，就还需要在局部涂抹抗病毒的眼膏进行联合治疗，避免眼睑皮肤因为疱疹感染发生溃烂。
但是，需要注意的是使用上述药物都必须在医生的指导下进行，不要自己随便点用，此外患者还可以自己使用生理盐水进行局部的湿敷。