病毒性结膜炎用抗病毒的眼药水以及抗生素类的眼药水联合使用。
如果病情较重，可以考虑眼药水的使用次数增加，建议两种眼药水交叉滴用，可以达到平均每一小时一次。如果病毒累及到角膜引起浸润，建议滴用激素类的眼药水，避免角膜出现瘢痕。如果患者异物感非常明显，一定要翻转上下眼睑查看睑结膜面是否存在有膜状物，如果存在，一定要去除。
病毒性结膜炎的病程比较长，患者一定要有耐心，必要的时候还可以考虑口服抗病毒的药物或者静点抗病毒的药物。