肺心病的治疗，主要是降低肺动脉高压，控制心力衰竭，改善心功能，治疗原发病，即治疗慢性阻塞性肺病急性加重，改善呼吸衰竭。
肺心病治疗分为慢性缓解期和急性加重期的治疗。慢性缓解期的治疗，包括增加机体抵抗力，预防呼吸道感染，有条件的积极氧疗改善肺功能，严格戒烟，改变生活方式。而肺心病急性加重期的治疗，以缓解症状为主，即降低肺动脉高压，改善肺功能，缓解呼吸衰竭和循环衰竭。
常用的药物，包括利尿剂，如呋塞米、螺内酯。正性肌力药物，如洋地黄。血管扩张剂，如美托洛尔，以及控制感染药物，即敏感的抗生素。同时给予止咳、化痰、平喘药物对症治疗。