牙齿刷不干净会引起或加重牙周炎。牙齿刷不干净造成食物残渣、细菌及其代谢产物滞留在牙面或邻间隙形成牙菌斑，牙菌斑是牙周炎发生的始动因子，粘附于牙齿表面的牙菌斑若未及时清理干净，会在食物和唾液中矿物质的作用下逐渐沉积形成牙石，形成以后不能以刷牙的方式去除。
牙石被认为是牙周炎发展的重要影响因素，由此可见，有效的刷牙是预防牙周炎发生和发展的有效措施。
目前，比较提倡的刷牙方法是巴氏刷牙法，建议早晚刷牙，每次3-5分钟，每半年到一年进行牙周洁治。