肛瘘不手术一般并不能自愈。
因为肛瘘是肛管以及肛门周围皮肤之间出现异常的瘘道，而肠道内的感染物质，包括粪水以及肠道黏液等，会经肛管处的内口进入肛瘘的瘘管。会反复导致瘘管内出现感染，甚至是化脓性的感染，致使瘘管内产生脓液。而脓液会经肛瘘位于肛门周围皮肤处的外口流出，这个过程是持续存在，所以导致肛瘘并不能自愈。
会表现为反复的肛门周围肿痛，以及流脓的症状，并且在肛门周围可触及条索状的肿物就是肛瘘的瘘管。所以肛瘘患者均需要通过手术治疗才能治愈，需要将瘘管以及内口切开，使其重新愈合。