浅表萎缩性胃炎要注意筛查是否有幽门螺杆菌感染。
如果有幽门螺杆菌感染，及时杀菌治疗。根除幽门螺杆菌后，有可能会逆转胃黏膜萎缩状态，减少罹患胃癌风险。如果没有幽门螺杆菌感染，可以服用保护胃黏膜的药物，比如替普瑞酮。定期复查电子胃镜，注意调整饮食，戒烟、戒酒，避免损伤胃黏膜的因素。
此外，浅表萎缩性胃炎患者胃内腺体萎缩，胃酸分泌本来减少，不要随意应用抗酸药或抑酸药。如果经常出现腹胀、消化不良的症状，还可以对症应用动力药，比如多潘立酮、莫沙必利等缓解腹胀。也可以用辅助的中成药，比如健胃消食片。