对于乙肝的诊断，随着目前检测技术水平的提高，乙肝的误诊率非常的低，但是一些特殊情况下，也有可能会发生乙肝的误诊。
首先受检测试剂的影响，或者患者自身具有一些特殊的疾病，尤其是一些结缔组织病或者是免疫系统的疾病，可能会出现一些指标的异常结果，出现乙肝指标的假阳性，容易被误诊为乙肝。
另外也有可能是乙肝病毒感染者，被误认为是非乙肝患者，尤其是表面抗原在极低的水平情况下，试剂的不灵敏或者操作的误差，可能出现不同的结果，容易出现疾病的误诊。
另外对于一些慢性肝病患者，如果乙肝5项指标的异常，比如e抗体或者核心抗体阳性，也可能会被误认为是乙肝，其实乙肝5项不同的检查结果，代表不同的临床意义，应该在医生的指导下进行正确的解读。