有部分人群因为体质原因，对皮蛋会产生过敏反应，不能够吃皮蛋。
除此以外，肝脏疾病的患者也不宜过多食用皮蛋。因为传统方法制作的皮蛋当中铅含量相对比较高，而铅又是一种有毒的重金属物质，需要在人体肝脏中进行解毒。肝功能不好时，铅无法被排出体外，就容易导致铅中毒。铅还会影响儿童骨骼、牙齿以及神经系统发育，因此处于生长发育阶段的孩子也不建议吃皮蛋。
老年人过多食用皮蛋还容易患上老年痴呆和骨质疏松等疾病。