输卵管囊肿手术切除之后是否会影响怀孕，需要根据手术的方式来决定。
如果是输卵管的系膜囊肿，不会影响到输卵管的功能，及时手术治疗不会影响以后生育。但若是输卵管积液或者是粘连引起的囊肿就需要切除输卵管，就会影响到以后生育。若是切除一侧，只要对侧的输卵管通畅也可以生育，但怀孕几率会降低，并不是绝对就不能够再怀孕。
所以，输卵管囊肿切除后，如果有受孕计划一定要检查输卵管是否通畅，只要输卵管通畅，排卵正常，单纯的切除输卵管囊肿对怀孕影响不大。