黄豆吃多了会增加胃肠道的负担，导致患者出现消化道方面的症状。黄豆里面含有的蛋白质比较多，摄入过多不容易被消化和吸收，还会增加胃肠道的负担，患者容易出现肠胃不适的症状。
消化道方面的疾病、消化不良的患者也不能多吃黄豆，吃黄豆过多蛋白质会在体内滞留较长时间，会产生较多的气体，导致人体出现腹部胀气的情况；蛋白质还会产生非蛋白氮，通过人体的肾脏排出，加重肾脏负担。
豆类食品里面含有的嘌呤比较多，痛风的患者不能吃过多黄豆，否则会导致痛风发作。