肛门边上长痘痘可能是因为毛囊炎、肛周湿疹、尖锐湿疣所导致的症状。
毛囊炎是较常见的皮肤炎性疾病，主要是因为感染了细菌或者真菌所引起。也有部分是与人体的免疫功能有关系或者过敏所导致，主要表现为肛门部位出现有红色的丘疹，像长痘痘一样，部分人还会出现有化脓、瘙痒、疼痛。肛周湿疹也会表现为肛门部位有小痘痘，因受到真菌感染后，会导致出现较硬的小丘疹，还会伴随有粘液渗出。
另外，也有可能是尖锐湿疣，是一种性传播疾病，主要表现为颗粒状的凸起。