短效避孕药有时候会影响月经，在服药期间有一些女性会出现月经不规律，大约有1%~2%的妇女可以发生闭经，绝大多数都是发生于平时月经就不规律的妇女。
另外服用避孕药期间，有些女性也会出现不规则的阴道流血，大多数都是发生在漏服用避孕药物之后，少部分的患者在没有发生漏服避孕药，也会发生不规则阴道流血。
流血少的仅是点滴样的出血一般不需要处理，但如果流血偏多的患者，应该尽量在服用避孕药物同时加用雌激素直到停药。如果患者流血量接近平时月经量应该立即停止服药，并且作为一次月经来潮要及时咨询医生。