紧急避孕药会对月经产生影响，可能会导致月经周期的改变。因为紧急避孕药的主要成分是左炔诺孕酮，含有大量的孕激素，会改变体内激素水平，影响月经周期。
大多数人服用紧急避孕药在7~10天左右，会出现阴道出血的症状，是药物引起的撤退性出血，主要是因为激素的改变所导致。因为会影响和干扰卵巢的正常排卵，可能会导致月经推迟的情况。
紧急避孕药不能够长期服用，不能作为常规紧急避孕，一般一年建议最多不要超过三次，否则可能会引起排卵功能障碍，月经改变，还可能会诱发子宫肌瘤。