许多疾病会出现小便有点痛，因为尿路感染引起的小便有点痛，除疼痛症状以外，还会合并有尿频、尿急等症状。这时可以口服头孢三代类的抗生素，比如头孢克肟、头孢地尼，或者是喹诺酮类的药物，比如左氧氟沙星，治疗尿路感染引起的尿痛症状。
有时候患有输尿管下段结石，也会引起小便有点痛，结石不算太大，可以口服排石颗粒或者是α1A受体阻滞剂，比如坦索罗辛促进结石早日排出体外，结石排出后小便疼痛症状也会消失。
膀胱肿瘤侵犯尿道引起的小便有点痛，能做手术的最好做手术，肿瘤引起的尿痛症状，可以口服止痛药物缓解小便疼痛的症状。