神经源性膀胱主要与以下疾病相鉴别：
1.前列腺增生症：发生于50岁以上男性，有排尿困难，尿潴留，严重者引起肾，输尿管扩张积水，直肠指诊，膀胱镜检查，膀胱造影可明确诊断。
2.膀胱颈梗阻：女性有排尿困难和尿潴留，肛门周围皮肤及会阴部感觉正常，膀胱镜检查或尿流动力学检查可鉴别。
3.先天性尿道瓣膜：多见于小儿，有排尿困难，尿潴留，尿道镜检查或尿道造影可鉴别。
4.女性压力性尿失禁：逼尿肌功能正常，尿道阻力降低，膀胱颈抬高试验阳性，膀胱尿道造影可见膀胱尿道后角消失，膀胱颈位置降低。
5.尿道狭窄：可为先天性或后天性，以排尿困难为主要表现，尿道探子检查有明显狭窄段，尿道造影可明确诊断。
6.膀胱颈部梗阻：排尿困难多伴有排尿疼痛，在排尿过程中可突然发生尿流中断现象，超声检查可见强回声，平片可见不透光阴影，膀胱镜检查可明确结石大小、数目。
7.膀胱癌：位于膀胱颈部，三角区域附近的带蒂肿瘤因堵塞尿道内口可以引起排尿困难，尿潴留等症状，但患者一般有间歇性地无痛性血尿，尿脱落细胞检查可以发现癌细胞，IVU可见膀胱区充盈缺损，膀胱镜检查可以直接明确肿瘤的部位、大小、数目，并可以同时取活组织进行检查。