肝脏小囊肿形成的原因，包括后天性肝囊肿形成的原因和先天性肝囊肿形成的原因。
其中后天性肝脏小囊肿形成的原因，主要是由于肝脏内的胆小管由于炎症、水肿、结石、疤痕、外伤等因素而导致，一般这种情况在临床当中还是比较常见，多为单发。而先天性的肝囊肿主要是由于患者肝内的胆管和淋巴管在胚胎时期便出现发育障碍，或者是在胎儿期患儿患有胆管炎，引起肝内小胆管闭塞而导致肝脏小囊肿的形成。
但是，肝脏小囊肿一般为良性的病变，患者不需要太过紧张和担心。