肛门里面胀痛是否能够自行恢复，需要结合导致肛门胀痛的原因。
如果是因为局部感染所引起的，比如肛窦炎、肛周脓肿导致的肛门胀痛，大多并不能自己恢复，需要通过使用抗生素抗炎或者手术治疗，才能控制胀痛症状，少部分感染并不严重的肛窦炎和肛周脓肿，可能可以通过自身的免疫系统控制局部感染，使胀痛症状缓解。
如果是内痔血栓形成或者内痔水肿所导致的肛门内胀痛，多数患者随着病情的缓解，肛门内的胀痛症状也会逐渐恢复。另外，如果是肠道内的疾病所导致的肛门胀痛，大多并不能自己恢复，需要明确病因采取相应的治疗。