肺、胸膜阿米巴病是由于肠道内的阿米巴原虫，侵犯到肺和胸膜引起的肺炎、胸膜炎、脓胸等。患者通常会出现畏寒、发热、乏力、食欲减退等全身症状。
肺内阿米巴原虫感染以后可以表现为咳嗽、咳痰，初期通常为干咳，后期会出现咳痰，可以是黄痰。部分患者也会出现特征性的巧克力色痰，也有部分患者会出现咳血痰的情况。
阿米巴原虫侵犯胸膜以后会出现剧烈的胸痛，通常是咳嗽时会感到胸痛更加加重明显。也可以出现胸腔积液，若胸腔积液量多，压迫肺脏，患者会有呼吸困难的表现。