婴儿打嗝不止可能为生理性因素所引起，也可能为病理性因素所引起。
常见于生理性因素，由于小婴儿神经发育并不是很完善，神经的反射也存在不协调性，容易受到外界因素的影响而使膈肌产生痉挛，比如进食过快，吸入过多的冷空气或受到寒冷刺激，都可引起膈肌痉挛，而出现打嗝不止的情况。一般伴随孩子月龄增长，神经系统会慢慢发育完善，打嗝的情况也会越来越少。
少数婴儿可能为病理性因素所引起，常见于脑肿瘤、脑炎、癫痫等中枢神经系统病变，也可见于膈肌占位、胃食管反流等，都可导致婴儿打嗝不止。