龟头糜烂的出现，首先考虑，它是由包皮龟头发炎引起的局部炎症导致糜烂、坏死、水肿、疼痛、红肿，通常与包皮过长直接相关，易复发。包皮过长，做包皮环切手术后，可以从根本上解决问题。
也需要考虑到男性梅毒感染者，此时也会出现龟头糜烂，通过验血可确诊。龟头糜烂甚至可能是阴茎癌的早期表现，此时需要取局部组织进行病理检查，才能确诊。
如果只是常见的炎症感染，局部应用红霉素软膏和口服消炎药即可治愈。诊断梅毒时可以用青霉素治疗。阴茎癌应考虑手术治疗，手术越早越好。术后还需定期放化疗。