龟头部位糜烂原因比较复杂，需要根据不同的病因和疾病类型来选择治疗方法。
如果是普通的细菌真菌感染所导致的龟头糜烂，可以使用复方黄柏溶液清洗，然后外用红霉素软膏、酮康唑软膏等。如果是生殖器疱疹导致的龟头糜烂，就需要使用具有抗病毒的药物来外用，比如阿昔洛韦软膏，也可以口服一些提高免疫功能的药物来治疗。
龟头糜烂时间过长存在癌变的可能，尤其是长期包茎病史的中老年患者，需要留取活组织病理检查。如果确诊是阴茎癌，就需要通过手术治疗。