甲亢的时候吃硒酵母可以补充硒，对甲状腺疾病的治疗有一定的辅助作用。但是，补硒治疗一般不能过长，一般疗程是半年。
对于亚临床甲亢患者，吃硒酵母是起到辅助作用，对于甲亢这个病情的控制有一定的帮助。但是要想把甲亢这个疾病给治愈，不能单靠硒酵母。
甲亢的治疗方法有三种，包括药物、碘-131和手术，药物是甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶这两类药物。所以甲亢患者在使用药物来治疗甲亢的时候，可以同时小剂量使用硒酵母来做辅助治疗。但是主要还是使用抗甲状腺药物，才能使血中甲状腺激素水平逐渐恢复正常。