真菌性肠炎的主要症状有身体出现低热感、腹痛、腹泻、大便多数呈现绿色或黑色。所以，当患者出现此症状时，最好去当地正规医院进行详细检查，并且可以通过大便常规检查或是真菌培养的方式进行确诊。
如果确定是真菌性肠炎的患者，可以在医生指导下服用相关的药物进行调理。一般坚持一周时间身体就会慢慢得到恢复。
在治疗期间一定要注意饮食问题，最好以清淡、易消化的食物为主。如果食物太过油腻或刺激，则会加重病情的发展。