中东呼吸综合征可以通过呼吸道传播，但是不能简单地归为呼吸道传播疾病。
本病的传播途径主要有两种，动物、人，以及人、人。其中在人和人之间的传播主要是通过呼吸道的飞沫，或者是密切接触引起的。经常发生在与患者密切接触的家庭，以及医护人员之中，这是疫情扩散的主要形式。
但是在中东地区，比较多见的是动物和人之间的传播，常常会引起散发的病例。具体的传播途径还不清楚，可能是通过接触感染的骆驼的排泄物、分泌物或者是没有煮熟的肉，以及乳制品等引起。