阴茎内疼痛，通常考虑和尿道疾病，或者阴茎海绵体疾病有关。
例如患有尿道炎、尿道囊肿后，会导致尿道肿胀压迫阴茎神经，这时就会引起阴茎内疼痛。患有阴茎硬结症时，会压迫阴茎海绵体，导致阴茎海绵体充血，这时也会引起阴茎内疼痛。
另外阴茎内疼痛，通常还和阴茎外伤，导致阴茎皮下淤血压迫阴茎黏膜神经有关，这时会伴随着明显的阴茎肿胀感。建议面诊泌尿科医师，做阴茎超声检查，明确具体病因。在该诊断后，要保持阴茎放松、尿路通畅，忌口辛辣食物。