肺放线菌病所引起的并发症与肺部感染的程度有关。
当肺放线菌病感染的病灶波及胸膜时，可以诱发患者产生胸膜炎。部分患者还可以产生胸腔积液，如果未及时有效地处理，胸腔积液的感染程度可进一步地加重形成脓胸。患者可以出现明显的畏寒、发热等现象。部分严重的肺放线菌病可侵犯胸壁，形成相应的窦道或瘘管而经久不愈。
如果放线菌侵犯纵隔时，可以导致患者出现呼吸困难或者是吞咽困难等，严重的患者还有生命危险。此外，肺放线菌病还容易导致肺脓肿的形成，部分患者可以并发放线菌的脓毒血症或其他器官的功能损害等。