真菌性脑膜炎的治疗药物，主要包括以下几类：
1.两性霉素B。这类药物对于所有的真菌几乎都具有活性，临床上主要应用于念珠菌、曲菌、新型隐球菌等引起的全身或内脏感染。用于治疗真菌性脑膜炎，可起到抗真菌的作用，利于控制病情，缓解临床症状。
2.氟胞嘧啶。该药属于抑制剂，具有明显的杀菌作用，临床上应用于治疗隐球病、念珠菌病以及其他敏感真菌所引起的感染，用于真菌性脑膜炎患者，可达到抑制真菌产生的效果。
3.吡咯类药物。临床常用药物主要有伊曲康唑、氟康唑等，该类药物可以和菌体包膜相结合，利于胞浆外渗，致使菌体得到溶解而死亡，具有杀灭真菌的作用。