脑血栓不是脑栓塞，虽然脑血栓与脑栓塞都属于缺血性脑卒中，但是其发病机理是不同的。
脑血栓主要是由于血管内的栓子脱落堵塞脑血管而引起一系列的临床表现，而脑栓塞主要是由于血管狭窄，导致脑部血液供应中断，引起脑组织损伤所致。
其次脑血栓多见于老年患者，而脑栓塞多见于青年人，脑血栓多在静态时起病，且发病较为缓慢，而脑栓塞发病非常急，尤其是心房颤动的患者，病情在数秒中即可达到高峰。二者在病因、病情上都有明显不同。