脑血栓和脑栓塞的区别是栓子的来源不同。脑血栓的栓子来源都在颅腔以内，脑栓塞的栓子来源在颅腔以外，两者相比，脑血栓的危害程度更小一些，患者多数的会表现为肢体的瘫痪、失语以及会出现智力或者记忆能力的下降等。
而脑栓塞堵塞的血管都是比较大，所以很容易危害到患者的意识，会出现昏迷以及呼吸衰竭、循环系统的衰竭等，所以危及到患者的生命。所以脑血栓和脑栓塞的区别，首先就是栓子来源不一样，再就是危害程度也有一定的差距。
当然最确切的方法，还是进行影像学检查以及血管造影，追问患者是否有房颤等基础疾病。