膈肌膨出的治疗具体方法，需要根据患者的病情以及自身的情况而定。
如果患者出现明显的症状，一般选择外科治疗，目的是让膈肌恢复到正常的位置，这样才能够稳定纵隔，从而使患者恢复正常呼吸。如果有严重的呼吸困难或者是紫绀的症状，需要立即进行气管插管或器械辅助呼吸，之后紧急进行外科治疗。
常见的治疗方法是胸膈肌折叠术，通过切开胸部，将薄弱的膈肌进行折叠缝合，之后加以缝合固定，使膈肌位置下降距离缩短即可。如果是双侧膈肌膨出，需要纠正两侧的病变，依然是采取手术治疗，只是治疗需要分期进行。两期手术之间，需要相隔数周才行。