右侧附件囊肿是否影响怀孕要看囊肿的性质：
1.如果是生理性卵巢囊肿，当排卵期以后，由于黄体没有完全萎缩而引起黄体囊肿，这种情况一般不会影响怀孕。如果没有怀孕，等下次来月经以后，黄体囊肿有可能就已经萎缩消失了。
2.如果是未破裂的卵泡，在排卵期的时候没有正常破裂，如果在这一个月内备孕期间有可能会影响这一个月的怀孕，如果下次备孕卵泡正常破裂，就不会影响正常怀孕的。
3.如果是病理性卵巢囊肿，有可能是由于炎症引起的，这种情况就有可能会影响怀孕。