肛乳头瘤出现疼痛，可以在肛门内塞入双氯芬酸钠栓止痛，肛门外可以涂抹利多卡因凝胶，缓解局部的疼痛。也可以口服止痛药、消炎药物缓解疼痛。
正常情况下，肛乳头瘤是不会出现疼痛感。出现疼痛说明症状较严重，已经出现发炎、红肿，甚至溃疡。如果通过用药还不能缓解的情况下，必须要及时做手术，将肛乳头瘤切除。
术后再静脉点滴抗生素抗感染治疗，并配合用中药坐浴，促进伤口的愈合，伤口消毒换药，最终才能改善局部的疼痛感，术后要保持大便通畅。