断指再植是会留下疤痕的。一般情况下皮肤损伤超过真皮层都会留下疤痕，只是大小、深浅不同而已。愈合好的皮肤只会留下一条细小的线状疤痕，如果是瘢痕体质的人可能会留下粗大的疤痕，突出于皮肤表面。
断指再植是把不完全或完全离断的手指重新接回原位，通过血管神经显微镜下吻合，使其重新恢复功能的一种手术方式。手指离断时，皮肤完全断裂，表皮及真皮层完全破坏。
所以，重新吻合修复后是会留下疤痕的，只是根据个体差异，大部分病人只会留下细小的线状疤痕，瘢痕体质的病人，则会留下较为粗大的疤痕。