内分泌失调的原因主要是激素代谢紊乱。内分泌激素代谢紊乱有许多类型，一种类型是激素的量增加导致，可以有激素在体内产生过多。比如一些内分泌腺的肿瘤，也可以是含有激素的药物或化妆品使用过多导致。
另一种是激素的量减少导致，可以有内分泌腺遭到破坏的疾病，例如自身免疫疾病、放射损伤、内外伤引起的缺血坏死，手术切除等。也可以是内分泌激素合成出现障碍，或者内分泌以外的疾病继发引起内分泌腺分泌激素异常的疾病。
最后一种类型是靶细胞或者是组织对激素存在的抵抗所引起。