葡萄膜炎的并发症有：并发性白内障，炎症反复发作或慢性化，造成房水改变，影响晶状体代谢，从而引起白内障。这种白内障主要为晶状体后囊下浑浊。
此外，在葡萄膜炎时，由于长期滴用糖皮质激素滴眼液，也可引起晶状体后囊下混浊；继发性青光眼，葡萄膜炎时，可因炎症细胞、纤维蛋白性渗出以及组织碎片阻塞小梁网，虹膜周边前粘连或小梁网的炎症，使房水引流受阻，瞳孔闭锁、瞳孔膜闭阻断了房水由后房进入前房，引起继发性青光眼；低血压及眼球萎缩，炎症反复发作或炎症的慢性化，可导致睫状体脱离或萎缩，房水分泌减少，引起眼压下降，严重者可致眼球萎缩。