乳管瘘的病因从临床上看是由于乳头发育不良，导致输乳管堵塞的免疫性反应。
通常乳汁淤积导致细菌侵入输乳管并大量繁殖，是哺乳期乳管瘘主要的发病因素。其次，有些患者有乳头内陷的症状，这会使局部无法保持清洁，从而引起细菌感染，也是乳管瘘的病因之一。再者，导管扩张使鳞状上皮从导管口向內部延伸,覆盖导管内壁上,其角化鳞屑及脂质分泌物阻塞导管,细菌侵入也会引发感染。感染后引起引流不畅，形成乳晕旁脓肿,继而破溃,或引流后形成瘘管。
如果已经确诊，建议早日接受治疗。