眼眶寄生虫囊肿，如果是猪囊尾幼虫引起，可以沿肿大的眼外肌纤维切开囊壁，取出虫体，切除部分囊壁，冲洗囊内，术后用抗生素或糖皮质激素减轻炎症反应。
裂头蚴虫病导致的寄生虫囊肿，治疗时可以局部切开，放出囊液，取出蚴虫，反复冲洗，将全部拿囊内容除去，位于眶内者，仔细探查，务必将全部裂头蚴完整取出。
包虫病可用针穿，吸出囊液，注入酒精或甲醛，杀灭幼虫，盐水反复冲洗，术后口服糖皮质激素，也可手术切除，因肉芽组织与眼外肌和视神经黏连，只切除部分肉芽肿，取出幼虫，反复冲洗即可。