月经周期长是存在一定危害的，比如子宫内膜会相对地增生时间比较长，在临床上就有可能会导致相应的病变，尤其是当临床上出现多囊卵巢综合征的情况下，月经周期往往是延长的，甚至会出现闭经的现象。
临床要给予干预，否则子宫内膜在雌性激素的刺激下可能会导致癌变。所以对于多囊卵巢综合征引起的月经周期延长，一定要引起重视，并且积极地给予干预。
另外月经周期延长在临床上的危害，就有可能会导致不孕不育现象的发生，主要是因为月经周期长无法计算相应的排卵时间，所以不能正确地指导同房，有可能会导致不孕不育。往往需要通过B超来监测、了解卵泡的生长发育情况，然后再同房，会提高怀孕几率，减少危害。