机会性感染是指免疫功能低下时才会出现的感染。感染的病原微生物多数致病力不强，健康人一般很少感染。此外长期应用抗菌药物导致的肠道菌群紊乱，继发的细菌或者真菌的感染，这种情况也属于机会性感染。机会性感染的病原可以来自于体内，这些病原正常状态下可以在人体内寄生，当免疫功能低下时才会引起发病。
另外，也可以来源于外界，称为外源性感染，比如诺卡菌，一般不在人体寄生，免疫功能低下时，可以引起感染。常见的机会性感染引起的病原微生物包括以下几类：
第一类，细菌，其中包括结核杆菌、非结核分支杆菌、诺卡菌等等。
第二类，包括病毒，其中巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒感染的几率相对比较多。
第三类，是真菌，一般包括各种真菌，都属于机会性的感染。
第四类，包括寄生虫，比如卡氏肺孢子虫、弓形虫的感染都属于机会性的感染。