血管免疫母细胞性淋巴结病，需要和非霍奇金淋巴瘤进行鉴别诊断，最主要的鉴别手段是通过淋巴结的病理检查。
非霍奇金淋巴瘤，一般情况下有淋巴结结构的破坏，有单一的淋巴瘤细胞浸润，而没有血管免疫母细胞性淋巴结病的三联征，也就是血管免疫母细胞增生、树枝状血管增生和间质中嗜酸性物质的沉积。
血管免疫母细胞性淋巴结病，还需要和组织细胞坏死性淋巴结炎进行鉴别诊断。
组织细胞坏死性淋巴结炎，是一种由于病毒感染引起的淋巴结的非化脓性炎症，主要临床表现为发热、淋巴结肿大、淋巴结压痛，常有白细胞减少，部分患者也有肝脾肿大、皮疹，是一种良性的病变，可以通过病理检查来进行鉴别。