咽鼓管炎是否可以自愈，需要取决于引发咽鼓管炎的病因。
如果引发咽鼓管炎的病因是鼻病毒，或腺病毒等病毒感染引发的急性感冒，造成咽鼓管腔的堵塞以及充血、水肿，症状不严重的情况下，在急性鼻炎自愈之后咽鼓管炎通常也会自行痊愈。另外，如果是由于乘坐飞机等交通工具导致的巨大的气流变化，引发咽鼓管内的充血、肿胀和堵塞造成的咽鼓管炎，通常也会随着乘坐交通工具的结束和气流的恢复正常而自行痊愈。
但如果咽鼓管炎的症状比较严重，已经引发了鼓膜穿孔或咽鼓管腔内有细菌炎症感染，则自愈可能性比较低。