要诊断沙眼，首先要采取患者的病史、症状，在通过眼部的专科检查了解患者的体征，结合实验室检查可以诊断。
沙眼是由沙眼衣原体感染导致的，取患者的眼部分泌物进行培养可发现沙眼衣原体。患者有明显的眼红、异物感、眼痛、畏光流泪、分泌物增多等症状。
患者有睑结膜乳头、滤泡增生形成的砂粒样外观，并且可伴有角膜血管翳， 慢性期形成睑结膜瘢痕等特征性改变。患者常有接触沙眼患者的病史，或者周边有沙眼流行的病史。