甲减和桥本甲状腺炎在临床上可以说是互相包括的疾病，甲减里面可以有桥本甲状腺炎所导致的甲减。
而桥本甲状腺炎可以分为甲亢期和甲减期，所以这两种疾病的超声诊断在某种程度上会有所覆盖。甲状腺功能减退的超声表现为甲状腺大小形态正常或者偏大，有时会伴有不同程度的囊性改变。
一般甲状腺实质血流信号会减少，彩色多普勒局部血流在有些少数的患者会出现丰富。慢性淋巴细胞性甲状腺炎又名桥本甲状腺炎，超声表现为甲状腺弥漫性非均匀性的增大，多为前后性增大、有时可呈分叶状，腺体内回声减低增粗不均匀，可见条状分格样的高回声。