引起小脑梗阻的原因，主要包括以下两个方面：
1.可能为动脉粥样硬化所引起。由于动脉粥样硬化，导致局部脑血管产生斑块，久而久之会使血管管腔变得狭窄、血管壁也会明显增厚。严重时会导致脑血管血流量缓慢，致使局部脑组织供血、供氧不足，可能会引起小脑梗塞。如果受到某些因素影响，斑块脱落，伴随血液循环到达血管狭窄的部位，就可能会引起小脑梗阻。
2.可能为心源性的栓子脱落所引起。由于本身患有心脏病，导致心脏供血不足，容易在局部形成血栓。当栓子脱落后，伴随血液循环进入小脑，就很可能会引起小脑梗阻。