感染性急性小管间质性肾炎是由于各种感染的因素，导致患者的肾间质出现大量炎性细胞的浸润、肾间质水肿，肾小管的上皮细胞变性、有不同程度的坏死，而患者的肾小球和肾血管大多数正常或者是轻度病变。
引起急性小管间质性肾炎的感染有细菌感染，比如金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌等。也有病毒感染，比如流行性出血热病毒、麻疹病毒等。当然也包括螺旋体感染以及原虫感染。
由于感染了这些微生物以后，导致微生物或者其毒素引起患者出现变态反应，导致肾间质的炎症。急性小管间质性肾炎发病的基础就是免疫反应，通常会表现有寒颤、高热、咳嗽、皮疹、尿少、肾功能下降等。