肛瘘局部的硬块只有通过手术才能完全消除。肛瘘的硬块大多是瘘管组织，是由于反复慢性的炎症刺激导致瘘管纤维化而形成的，需要通过手术将瘘管切除，才能使硬块完全消除。
对于伴有急性感染的肛瘘，可能会导致局部出现红肿疼痛的症状，硬块会有所增大，患者可以通过使用抗生素控制局部的感染，但也只能使局部硬块缩小，并不能使其完全消失。
对于没有急性感染处于发作间歇期的肛瘘局部硬块，通过使用药物并没有治疗效果，患者也只有通过手术切除才能使硬块完全消失。