长期盐水洗鼻的危害，一般主要包括鼻腔黏膜损伤、充血、肿胀、破裂等，取决于个人的使用方法。
如果是长期使用生理盐水洗鼻且方法正确，基本上不会产生危害，在进行洗鼻时，可把鼻腔里分泌物、病原菌致敏原清除干净，减轻鼻腔黏膜充血或水肿现象，改善鼻炎症状或预防鼻炎。同时能够缓解鼻腔干燥。若使用方法不当，容易导致鼻腔黏膜菌群失调、鼻腔黏膜损伤等，引起毛细血管破裂、出血。
若用自制盐水洗鼻，危害就比较多，因为浓度配置不准确，且不是无菌的，容易损伤鼻腔黏膜，甚至引发严重感染。