上颌窦囊肿做以下的治疗：
1.手术治疗。主要针对囊肿比较大，囊肿经常出现破溃、流黄水或者囊肿局部伴有感染，引起鼻面部的膨隆或压迫患者的牙齿，导致牙齿出现不舒服。临床上一般建议手术处理，建议应用鼻内窥镜下上颌窦囊肿切除手术，可以从中鼻道进入，也可以从下鼻道进入。
2.如果囊肿很小，没有导致患者出现不舒服。临床上观察就可以，一般不需要进行手术治疗，也不需要进行药物治疗。
上颌窦囊肿，临床上非常多见，大多数是患者在做鼻窦CT的时候无意中发现的。